Rubriky
• portály, deklarace, petice, odborné diskuze

Vládní stránky USA o SARS-CoV2 pro odborníky

Obsahují odkazy na odborné články i seznam všech klinických studií v USA

https://www.nih.gov/health-information/coronavirus

Rubriky
• portály, deklarace, petice, odborné diskuze • pro neodbornou veřejnost

Vládní stránky USA o SARS-CoV2 pro veřejnost

https://www.coronavirus.gov/

Rubriky
• léčba, léky, ostatní • portály, deklarace, petice, odborné diskuze • testování (rRT-PCR, IgG, IGM, IgM, T-CD4+, CD8+)

Facts about COVID-19 portál Evropského centra pro kontrolu a prevenci nemocí (ECDC)

Informace pro laickou i odbornou veřejnost v angličtině. Jsou zde vzory informačních letáků pro nemocné s různými typy chronických onemocnění, pro těhotné ženy atd. .. V části Disease background je podrobně popsán vlastní virus, odkazy na mapu jeho genomu, jeho sezónní šíření, typy onemocnění u různých věkových a rizikových skupin nemocných.

https://www.ecdc.europa.eu/en/novel-coronavirus/facts

Rubriky
• imunitní a hematopoetický systém • testování (rRT-PCR, IgG, IGM, IgM, T-CD4+, CD8+)

Buněčná imunita a SARS-CoV2 – zásadní publikace

V renomovaném časopise Cells uveřejnili američtí autoři z Kalifornie, Severní Karolíny a Sinai Hospital z New Yorku článek o reakcích lidských T lymfocytů na SARS-CoV2 . V článku popisují metodiku kvantifikace množství virově specifických CD4 + a CD8 + T lymfcoytů. To poskytne poznatky o imunitě a patogenezi infekce SARS-CoV-2 pomůže navrhnout a vyhodnotit účinnost různých vakcín. Odhady imunity jsou také zásadní pro epidemiologickou kalibraci modelu budoucích sociálních distancujících opatření pro kontrolu pandemie. Modely se dramaticky liší v závislosti na tom, zda infekce SARS-CoV-2 vytváří samostatnou specifickou imunitu či zda existuje nějaká zkřížená imunita mezi SARS-CoV-2 a cirkulujícími sezónními „běžnými studenými“ lidskými koronaviry. Jedná se o 4 kmeny: HCoV-OC43, HCoV-HKU1, HCoV-NL63, a HCoV-229E.

Autoři podrobně vyšetřili 20 dospělých dobrovolníků, kteří se uzdravili po mírném průběhu COVID19, který nevyžadoval hospitalizaci.

Reakce CD4+ T lymfocytů na antigeny SARS-CoV-2: V vyšetřované sestavě byla jasná hierarchizace. Většina CD4+ T lymfocytů reagovala proti těmto antigenům: ORFs spike – 27%, M-21% a N-11% epitopům. Další CD4+ T lymfocyty, specifické pro SARS-CoV-2 reagovala na antigeny nsp3-5%, nsp4-5% a ORF8-5%. Procenta udávají relativní počet CD4+T lymfocytů reagujících na daný antigeny ze všech CD4+T lymfocytů reagujících na antigeny SARS-CoV-2. V průměru tedy 50% CD4+ T lymfocytů reagovalo na spike protein a 50% zbylé antigeny SARS-CoV-2 ORFeomu (open reading frames).

Reakce CD8+ T lymfocytů na antigeny SARS-CoV-2 byla na antigeny na výběžcích (spikes) z 26% a N protein – 12%. Významná reaktivita u 19 zkoumaných subjektů byla proti dalším antigenům: M (22%), nsp6 (15%), ORF8 (10%) a ORF3a (7%).

Autoři potvrdili též korelaci mezi titrem protilátek IgG, IgM a IgA a specifickou buněčnou odpovědí T lymfocytů CD4+ a CD8+. Čím vyšší byl titr protilátek tím lepší byla buněčná odpověď.

Autoři také detekovali T lymfocyty zkříženě reagující s non-spike antigeny SARS-CoV-2 až u 50% zdravých jedinců, kteří neprodělali COVID-19. Toto zjištění podporuje ideu, že v lidské populaci existuje  potenciál  paměťové buněčné imunity díky expozici běžným tzv. studeným koronavirům.

Rubriky
• imunitní a hematopoetický systém • kardiovaskulární systém • léčba, léky, ostatní • plíce

Proč a jak přechází těžší respirační infekce SARS-CoV-2 do obrazu ARDS a onemocnění jiných orgánů?

V této úvaze navrhuji pravděpodobnou možnost a příčiny tohoto vývoje.

K přechodu do ARDS = severe COVID pravděpodobně dochází při rozvoji generalizovaného postižení endotelu= endotelitidě s následnou endotelovou dysfunkcí, vaskulitidou. Dochází k depozice nefagocytovaných imunokomplexů „specifická potilátky + SARS-CoV-2„ v endotelu. Vznikají též nejrůznější antifosfolipidové a antikardiolipidové autoprotilátky tzv. antifosfolipidový syndrom a rozvíjejí se tepenné i žilní trombózy, které embolizují do velkého i malého oběhu. Dochází k rozvoji
disseminované intravaskulární koagulace (DIC) s následným možným krvácením – např. do CNS, mozkovým infarktům, k selháním ledvin etc..

Rubriky
• pro neodbornou veřejnost • testování (rRT-PCR, IgG, IGM, IgM, T-CD4+, CD8+)

Stabilita viru SARS-CoV-2

Studie hongkongských autorů zkoumala schopnost viru SARS-CoV-2 přežít v různých podmínkách. Zkoumán byl vliv teploty prostředí a vliv materiálu, na který byly virové částice naneseny.

Virus přežívá velmi dlouho v nízkých teplotách. Například při teplotě 4 °C byla prokázána přítomnost životaschopných virových částic ve tkáňové kultuře i za 14 dní od aplikace. Naopak při vyšších teplotách dochází relativně rychle k inaktivaci viru. Při teplotě 56 °C došlo k inaktivaci viru za 30 minut a při teplotě 70 °C již za 5 minut.

Při studiu vlivu materiálu na délku „přežití“ viru při pokojové teplotě bylo zjištěno, že virus „přežívá“ velmi dlouho na zevním i vnitřním povrchu chirurgické masky (více než 7 dní). Životaschopné částice viru na nerezové oceli a plastech nebyly zjištěny po 7 dnech, na skle a bankovkách po 4 dnech, na opracovaném dřevě a na textilu nebyly prokázány po 2 dnech. Nejkratší doba existence životaschopného viru byla zaznamenána na papíru do tiskárny a papírových kapesnících (3 hodiny).

Zdá se, že materiály s hladkým povrchem svědčí viru lépe. Důležitý rozdíl od běžných podmínek je ten, že byla zkoumána jedna kapénka o velikosti 5 µl (0,005 ml), ale infekční nálož při mezilidském kontaktu může být výrazně vyšší. Dalším, tentokrát pozitivním rozdílem od běžného života je ten, že pouhá detekce životaschopného viru v laboratorních podmínkách ještě nutně neznamená, že materiál musí nést potenciál nakazit člověka.

https://www.thelancet.com/journals/lanmic/article/PIIS2666-5247(20)30003-3/fulltext

https://www.thelancet.com/cms/10.1016/S2666-5247(20)30003-3/attachment/cb3624c2-996e-4202-a337-5cf60df1021e/mmc1.pdf

Rubriky
• incidence, mortalita, statistické analýzy • portály, deklarace, petice, odborné diskuze

Webový portál švédských jednotek intenzivní péče a počty hospitalizovaných s COVID19

Tento portál poskytuje informace o počtu hospitalizovaných v jednotlivých švédských městech a nemocnicích, o věkové struktuře i rizikových onemocněních hospitalizovaných pacientů s COVID19. Údaje jsou každodenně aktualizované.

Počet nově hospitalizovaných nemocných na JIP ve Švédsku od začátku května pomalu klesá navzdory nezavedení karantény a neuzavření základních škol a školek. Celkový počet hospitalizovaných a zemřelých je však v porovnání s ČR cca desetinásobný. Ale například oproti Francii či Irsku se o mnoho neliší, ačkoli v Irsku je přísná karanténa a uzavřené školy pro žáky od 12.3. až doposud (23.5.). Ve Francii je kromě uzavření škol též omezeno cestování mezi kraji atd. atd.. Opatření ve Francii, zelené a červené zóny https://www.bbc.com/news/world-europe-52615733 a přetrvávající omezení shromažďování včetně náboženských https://www.france24.com/en/20200523-france-to-allow-religious-gatherings-with-worshippers-in-masks-after-covid-19-ban

https://www.icuregswe.org/data–resultat/covid-19-i-svensk-intensivvard/

Opatření v Irské republice jsou shrnuta zde https://www.theguardian.com/world/2020/may/02/ireland-extends-covid-19-lockdown-to-18-may-before-phased-exit

Rubriky
• incidence, mortalita, statistické analýzy • ledviny

Histopatologické nálezy na ledvinách při pitvách zemřelých na COVID19

Čínští autoři podrobně popisují post mortm nálezy na ledvinách u 26 zemřelých na COVID19. Prokazují četné a výrazné erytrocytové agregáty, blokující kapilární lumen. Tyto agregáty neobsahovaly trombocyty ani fibrinoidů. Patologové neprokazují známky vaskulitidy, intersticiálního zánět nebo krvácení. Vyšetření pomocí elektronového mikroskopu ukázuje shluky částic podobných koronavirům s výraznými hroty v tubulárním epitelu a podocytech. Dále bylo zjištěno, že receptor SARS-CoV-2, ACE2, je upregulovaný u pacientů s COVID-19 a imunobarvení pomocí nukleoproteinové protilátky SARS-CoV bylo pozitivní v tubulech. Studie poskytuje přímý důkaz invaze SARSCoV-2 do ledvinové tkáně.

Rubriky
• incidence, mortalita, statistické analýzy • populárně naučné - nerecenzované • pro neodbornou veřejnost

Počet provedených testů k průkazu jednoho případu dle státu

Na webové stránce ourworldindata.org lze interaktivně sestavit různé grafy týkající se COVID19. Na grafu lze porovnat počet testů v okolním zemích, v UK, v USA, ve Švédsku a pak v zemích nejvyšším počtem testů na jednu prokázanou nákazu. Je nutné zdůraznit, že se nejedná o počet testů k prokázání jednoho nemocného, ale jednoho nakaženého, který v době testu mohl být buď nemocný nebo zcela zdravý a bez příznaků (například při epidemiologické trasování kontaktů nemocného nebo při plošném testování v určité skupině nebo oblasti). Velmi vysoký počet testů tedy mají země, které testují plošně a poté země s velmi aktivním vyhledáváním možných infikovaných nemocných. Země, které vyšetřují jen nemocné s typickými klinickými obtížemi potřebují jen velmi málo testů k potvrzení jednoho nemocného s COVID19.

Rubriky
• imunitní a hematopoetický systém • testování (rRT-PCR, IgG, IGM, IgM, T-CD4+, CD8+)

Zánět nosohltanu je první fáze a nejčastější forma infekce COVID19

Zánět nosohltanu je nejčastější formou infekce, která vzniká u zdravých osob, které byly exponovány relativně malému množství viru. Je možné si představit, že v těchto případech se vdechnuté viriony vychytají již na úrovni horních dýchacích cest. Replikace viru v této oblasti vyvolá tvorbu α-interferonu, aktivaci NK buněk a případně i dalších nespecifických antivirových mechanismů, což stačí pro krátkodobou ochranu dolních dýchacích cest a plic. Specifická imunita nemusí být angažována vůbec nebo se omezí na tvorbu slizničních protilátek (IgA).
Infekce proběhne buď zcela bezpříznakově nebo s minimálními klinickými projevy, nerozeznatelnými od banálního nachlazení (common cold). Z příznaků charakteristických pro tento typ onemocnění lze jmenovat mírně zvýšenou teplotu, rýmu, pocit ucpaného nosu, zaujatost hlavy, poruchy čichu (anosmii) a rovněž poruchy chuti (dysgeusii). Infekce tohoto typu se šíří především kontaktním způsobem, prostřednictvím kontaminovaných předmětů (kapesníky) a rukou. Při užším styku je samozřejmě významný i přenos slinami. K šíření vzdušnou cestou dochází vzácněji, zejména při kýchnutí, a dále při křiku, zpěvu nebo u lidí, kteří mají tendenci při řeči prskat.

https://www.lidovky.cz/relax/zdravi/velky-manual-expertu-z-bulovky-jak-jsme-daleko-s-poznanim-koronaviru.A200507_123603_ln-zdravi_ele