Rubriky
• pro neodbornou veřejnost česky • testování (rRT-PCR, IgG, IGM, IgM, T-CD4+, CD8+)

Pochybnosti o tzv. studii kolektivní imunity, resp. studii studii protilátkové odpovědi (kromě IgA) provedené nenáhodným výběrem

Profesor epidemiologie Jiří Beran, ředitel Centra očkování a cestovní medicíny, polemizuje s prováděným testováním kolektivní imunity obyvatel Česka. Vlivem zvolené metodologie výsledkem nebudou informace, které očekáváme.

Studie kolektivní imunity nám zřejmě nepřinese očekávané informace o bezpříznakovém šíření viru v populaci a vlivu dosud prováděných protiepidemických opatření. Je totiž naplánována jen jako jednorázová studie, která si vytyčila za cíl sledovat imunitní parametry koronavirové infekce, jež by u zcela bezpříznakového průběhu neměly být přítomny. A ten lze očekávat až u 30-40% lidí. Rychlotesty nezahrnují buněčnou imunitu a odpověď v protilátkách třídy IgA, které mohou být pozitivní až v 15% populace exponované koronaviru.

Zdroj: https://www.idnes.cz/zpravy/domaci/jiri-beran-epidemiolog-ockovani-imunita-vakcina.A200501_182859_domaci_cern

Rubriky
• testování (rRT-PCR, IgG, IGM, IgM, T-CD4+, CD8+)

Infection fatality rate of SARS-CoV-2 infection in a German community with a super-spreading event

V německém městečku Gangelt ve Westphalen

byla testována promořenost kombinací anti SARS-Cov2-IgA a IgG metodou ELISA společně s PCR metodou – s výsledkem 15.5%, zmiňovaná fatality rate byla 0.36%…..

Rubriky
• testování (rRT-PCR, IgG, IGM, IgM, T-CD4+, CD8+)

Modifikace protokolu hodnocení PCR testu firmy Roche dle WHO

Pracovníci laboratoře v německém Augsburgu modifikovali protokol pro průkaz SARS-CoV-2. PCR test od firmy Roche hodnotí dvě cílové sekvence. Jedna ze dvou cílových sekvencí – E-Gen se vyskytuje i u jiných koronavirů. Druhá sekvence ORF-Gen je specifická jen pro SARS-CoV-2. V případě pozitivity pouze na E-gen při odděleném hodnocení obou sekvencí nebyl test hodnocen jako jasně pozitivní. Od 3.4.2020 vzhledem k vysoké prevalenci a na základě doporučení WHO je test hodnocen jako pozitivní i v případě pozitivity jen na E-Gen.

http://www.labor-augsburg-mvz.de/de/aktuelles/coronavirus

Rubriky
• testování (rRT-PCR, IgG, IGM, IgM, T-CD4+, CD8+)

Komentář MUDr. S. Pekové PhD k protokolu CDC pro rRT-PCR

Původní CDC protokol je diagnosticky nevhodný – je navržený na zbytečně variabilní oblast genomu viru (riziko falešných diagnostických negativit, pokud virus bude promutovávat, což evidentně činí), v komplikovaném provedení (3 „komplementární“ detekční reakce místo jedné „jasné, přesné a úderné“). Je to pracné a drahé a naprosto nevhodné pro „high-throughput screening“ populace v čase epidemie. Výsledek by by měl být dostupný rovněž v kvantitativním provedení (tak to provádíme u nás v laboratoři) – tedy jak moc je pacient pozitivní. Vyjadřuje se to v kopiích viru v daném objemu vyšetřovaného vzorku – má to velkou klinickou relevanci.

Navíc je původní CDC protokol poměrně nespecifický a detekuje lehounce i jiné slizniční koronaviry, ne jenom SARS-CoV-2. V případech slabých pozitivit SARS-CoV-2, které se ale mohou kvantitativně v průběhu několika dnů zvýšit, je původní CDC protokol špatný. My jsme jej předělali na 5′ UTR viru, která je pro tento virus naprosto unikátní a specifická. Tento nový a validovaný protokol jsme zdarma nabídli po celém světě (už je snad všude), má ho i řada tuzemských laboratoří, pouze ho prozatím nepoužívají velké laboratoře Fakultních nemocnic v ČR (ke dni 21.4.2020)

Schválil: Matouš Preininger